人力検索で質問するとき、ポイントは１００P以下は付けられないんですか？

はい。回答が集まらなかった場合など、100ポイントは過多かと思うのですが。以前は最低質問ポイントは50ポイントで、それに戻すようにアンケートのたびにはてなに要望しておりますが、回答はありません。
なお、100ポイント以上は終了時に加算できるようですので開始時点は100ポイントで設定なさるのがよろしいかと思います。

アンケートは50ポイントから可能です。
また複数設問を設ける場合には、回答数上限は50÷設問数以上を超えていればOKです。
(2問なら回答数25で良い)

はてなアイデア - 人力検索タイプの有料質問を50ポイントからスタート可能にする。アンケートとも整合とれますし、いわし的な使い方がしやすくなると思います。
といったアイデアも提案しています。良かったら支援お願いします。